Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTDSS1P48651 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms