Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

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Length 62 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 ALDH18A1-201ENST00000371221 3337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 MORC2-AS1-201ENST00000422995 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 ZNF304-204ENST00000598744 3331 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 RGS7BP-201ENST00000334025 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 AC092145.1-201ENST00000564809 2434 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 HNRNPUL1-202ENST00000352456 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 YY2-201ENST00000429584 2741 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PCP4P48539 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 C1S-201ENST00000328916 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 C1orf127-201ENST00000377004 2761 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 TOMM40L-202ENST00000367988 2708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 LMNA-206ENST00000368300 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 SLC14A1-205ENST00000502059 2371 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 HERC6-201ENST00000264346 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 APOBEC3C-201ENST00000361441 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 GRPEL1-201ENST00000264954 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 CENPP-201ENST00000375576 3088 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 TADA2B-205ENST00000515646 3818 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 RANBP20P-201ENST00000557256 2104 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 PLEKHG5-203ENST00000377728 3613 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PCP4P48539 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 AGAP6-203ENST00000618025 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 ZZEF1-201ENST00000381638 11456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 KLF6-207ENST00000542957 4537 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 CDHR4-202ENST00000412678 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 BCAS3-202ENST00000407086 3496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 CLDN19-201ENST00000296387 2859 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 GRM4-201ENST00000374177 3590 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 PCBP1-AS1-227ENST00000435880 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 TMEM107-208ENST00000532998 2358 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 COLQ-201ENST00000383781 2784 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 NR1I2-202ENST00000393716 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PCP4P48539 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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