Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SFNP31947 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFNP31947 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFNP31947 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFNP31947 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFNP31947 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SFNP31947 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFNP31947 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFNP31947 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFNP31947 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFNP31947 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFNP31947 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFNP31947 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFNP31947 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFNP31947 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SFNP31947 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFNP31947 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFNP31947 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFNP31947 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFNP31947 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFNP31947 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFNP31947 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFNP31947 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFNP31947 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms