Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPINB3P29508 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms