Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GCAP28676 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GCAP28676 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
GCAP28676 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms