Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA4P25789 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms