Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMNB1P20700 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms