Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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