Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDH1P12830 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDH1P12830 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDH1P12830 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms