Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APODP05090 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APODP05090 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APODP05090 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APODP05090 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APODP05090 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APODP05090 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APODP05090 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APODP05090 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APODP05090 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APODP05090 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APODP05090 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APODP05090 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APODP05090 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APODP05090 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APODP05090 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APODP05090 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APODP05090 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APODP05090 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APODP05090 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APODP05090 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APODP05090 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APODP05090 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APODP05090 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APODP05090 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APODP05090 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APODP05090 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APODP05090 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APODP05090 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APODP05090 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APODP05090 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APODP05090 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APODP05090 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APODP05090 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APODP05090 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APODP05090 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APODP05090 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
APODP05090 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APODP05090 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms