Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAPBO95292 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms