Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT4C9JH25 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms