Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GGTLC3B5MD39 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms