Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf47A7E2U8 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms