Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEMP2A6NFY4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEMP2A6NFY4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms