Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEU3Q9UQ49 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEU3Q9UQ49 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEU3Q9UQ49 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEU3Q9UQ49 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEU3Q9UQ49 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEU3Q9UQ49 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEU3Q9UQ49 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEU3Q9UQ49 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEU3Q9UQ49 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEU3Q9UQ49 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEU3Q9UQ49 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEU3Q9UQ49 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEU3Q9UQ49 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NEU3Q9UQ49 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NEU3Q9UQ49 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NEU3Q9UQ49 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms