Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC12A4Q9UP95 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms