Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIMS3Q9UJD0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms