Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SPASTQ9UBP0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPASTQ9UBP0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms