Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms