Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
UBQLN4Q9NRR5 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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