Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TMEM27Q9HBJ8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TMEM27Q9HBJ8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TMEM27Q9HBJ8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TMEM27Q9HBJ8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TMEM27Q9HBJ8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM27Q9HBJ8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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TMEM27Q9HBJ8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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TMEM27Q9HBJ8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TMEM27Q9HBJ8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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