Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TDRD1Q9BXT4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms