Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NMD3Q96D46 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NMD3Q96D46 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms