Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDAC10Q969S8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms