Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
USP9XQ93008 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
USP9XQ93008 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms