Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms