Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms