Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMIEQ8NEW7 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms