Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CSNK2A3Q8NEV1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CSNK2A3Q8NEV1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CSNK2A3Q8NEV1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CSNK2A3Q8NEV1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CSNK2A3Q8NEV1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CSNK2A3Q8NEV1 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CSNK2A3Q8NEV1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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