Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC112Q8NEF3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms