Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
LINC00612Q8N6U2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms