Protein–RNA interactions for Protein: Q8N140

EID3, EP300-interacting inhibitor of differentiation 3, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EID3Q8N140 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EID3Q8N140 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms