Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HACD2Q6Y1H2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms