Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC93Q567U6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms