Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSPP1Q1MSJ5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms