Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF1AQ16665 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms