Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC18A3Q16572 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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