Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F4Q16254 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms