Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZIC1Q15915 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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