Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CCNIQ14094 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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