Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CAPSQ13938 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CAPSQ13938 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms