Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNW1Q13573 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms