Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGDRQ13258 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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