Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC15Q0P6D6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms