Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FMODQ06828 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
FMODQ06828 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
FMODQ06828 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FMODQ06828 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FMODQ06828 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FMODQ06828 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FMODQ06828 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
FMODQ06828 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FMODQ06828 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FMODQ06828 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms