Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPCAP84074 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPCAP84074 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPCAP84074 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPCAP84074 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPCAP84074 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPCAP84074 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPCAP84074 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPCAP84074 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPCAP84074 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPCAP84074 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPCAP84074 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPCAP84074 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPCAP84074 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPCAP84074 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPCAP84074 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPCAP84074 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPCAP84074 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPCAP84074 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPCAP84074 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HPCAP84074 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
HPCAP84074 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HPCAP84074 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HPCAP84074 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms