Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A2P52657 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms