Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT8P50990 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT8P50990 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT8P50990 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT8P50990 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT8P50990 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT8P50990 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT8P50990 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT8P50990 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT8P50990 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT8P50990 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT8P50990 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCT8P50990 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCT8P50990 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8P50990 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8P50990 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8P50990 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8P50990 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8P50990 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8P50990 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8P50990 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8P50990 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8P50990 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8P50990 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8P50990 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8P50990 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8P50990 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8P50990 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8P50990 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8P50990 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCT8P50990 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms