Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSRP3P50461 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms